最下面是信号分析室，第二层光脑攻击对抗室，是第三层是星舰内部协调室，第四层是武器控制室，第五层就是舰长室。
萧明让机器人搜索下面的四层，每一个细节都不准放过，哪怕是明知道不能藏人的小角落，也要仔细检查。机器人不会偷奸耍滑，所以不用担心它们会有什么遗漏。而萧明自己则带着一百多机器人直接来到了第五层的舰长室。
舰长室又叫指挥室，舰长和参谋部就在这里发号司令。同时舰长室也是光脑室——事实上，和一个篮球场一样大小的舰长室里面，有一半的面积都被光脑核心给占据着。
如果说引擎室和动力室是星舰的心脏，那么这里，无疑就是星舰的大脑。
舰长室里也是一切如常，表面上什么都没有。不过萧明却在灵魂雷达上看到了许多残余的魂之碎片。这些都是消亡的魂所留下的，而且根本萧明这么多年来的经验来看，物之魂是几乎不会有残余的魂之碎片的，只要消亡，立刻被天地所吸收，而灵之魂残留的时间很短，一般来说不到一个小时就会完全的消散。只有人之魂才会有很长时间的残留。
如果死之前意念太深，或者本身足够强大，环境合适，这种魂之碎片残留的时间会非常的长，甚至可以用“年”来做时间单位。
而且随着魂经的修炼，萧明现在也开始明白了所谓的“人之魂”的真正含意，不是单独之的人类的灵魂。而是指的到达了一定意识灵性程度的灵魂。以魂经的概念，魂就是一种能量，只不过拥有意识。
以前萧明以为魂的区别就是物体本身，但是现在他才知道，真正区别魂的种类的，不是物体本身，而是魂之中所拥有的意识强弱。意识最低的就是物之魂，拥有一定灵性，但是自我意识不够明确，或者说是智力不够高的，就是灵之魂，而有清晰明了的自我意识，智力正常的，就是人之魂。至于天地魂，萧明现在还没弄明白。
因为有了这样的认知，所以萧明知道了，像是九星级以上的星兽，或者像是白冰那样的极为聪明的星兽，它们的灵魂也被归于人之魂。
因此萧明现在也不能肯定，这个舰桥里面残留的人之魂碎片，到底是人类的，还是别的什么东西。
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